Вопрос оптимизации работы системы мониторинга Nagios встает тем быстрее чем быстрее растет количество проверяемых ресурсов.
Поскольку в современных системах самое узкое место - диск, то первое что приходит в голову для оптимизации - уменьшить работу с диском